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  2  Module      : Gargantext.Core.Viz.Phylo.PhyloExample
  3  Description : Phylomemy example based on history of Cleopatre.
  4  Copyright   : (c) CNRS, 2017-Present
  5  License     : AGPL + CECILL v3
  6  Maintainer  : team@gargantext.org
  7  Stability   : experimental
  8  Portability : POSIX
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 10  -- | Cesar et Cleôpatre
 11  -- | Exemple de phylomemie
 12  -- | French without accents
 13  -}
 14  
 15  
 16  module Gargantext.Core.Viz.Phylo.Example where
 17  
 18  import Control.Lens
 19  import Data.GraphViz.Types.Generalised (DotGraph)
 20  import Data.List (nub)
 21  import Data.Map qualified as Map
 22  import Data.Text (toLower)
 23  import Data.Vector (Vector)
 24  import Data.Vector qualified as Vector
 25  import Gargantext.Core.Text.Terms.Mono (monoTexts)
 26  import Gargantext.Core.Viz.Phylo
 27  import Gargantext.Core.Viz.Phylo.PhyloExport
 28  import Gargantext.Core.Viz.Phylo.PhyloMaker
 29  import Gargantext.Core.Viz.Phylo.PhyloTools
 30  import Gargantext.Core.Viz.Phylo.SynchronicClustering (synchronicClustering)
 31  import Gargantext.Core.Viz.Phylo.TemporalMatching (temporalMatching)
 32  import Gargantext.Prelude hiding (toLower)
 33  
 34  ---------------------------------
 35  -- | STEP 5 | -- Export the phylo
 36  ---------------------------------
 37  
 38  phyloExport :: IO ()
 39  phyloExport = dotToFile "/home/qlobbe/data/phylo/output/cesar_cleopatre_V2.dot" phyloDot 
 40  
 41  phyloDot :: DotGraph DotId
 42  phyloDot = toPhyloExport phyloCleopatre
 43  
 44  --------------------------------------------------
 45  -- | STEP 4 | -- Process the synchronic clustering
 46  --------------------------------------------------
 47  
 48  phyloCleopatre :: Phylo
 49  phyloCleopatre = synchronicClustering $ toHorizon flatPhylo
 50  
 51  -----------------------------------------------
 52  -- | STEP 3 | -- Build the Level 1 of the Phylo
 53  -----------------------------------------------
 54  
 55  flatPhylo :: Phylo
 56  flatPhylo = temporalMatching (getLadder emptyPhylo') emptyPhylo'
 57  
 58  emptyPhylo' :: Phylo
 59  emptyPhylo' = joinRoots
 60              $ findSeaLadder
 61              $ appendGroups clusterToGroup 1 seriesOfClustering emptyPhylo
 62  
 63  ---------------------------------------------
 64  -- | STEP 2 | -- Build the cliques
 65  ---------------------------------------------
 66  
 67  
 68  seriesOfClustering :: Map (Date,Date) [Clustering]
 69  seriesOfClustering = toSeriesOfClustering emptyPhylo docsByPeriods
 70  
 71  
 72  docsByPeriods :: Map (Date,Date) [Document]
 73  docsByPeriods = groupDocsByPeriod date periods docs
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 75  
 76  ---------------------------------
 77  -- | STEP 1 | -- Init the Phylo
 78  ---------------------------------
 79  
 80  emptyPhylo :: Phylo
 81  emptyPhylo = initPhylo docs config
 82  
 83  phyloCooc :: Map Date Cooc
 84  phyloCooc = docsToTimeScaleCooc docs (foundations ^. foundations_roots)
 85  
 86  
 87  periods :: [(Date,Date)]
 88  periods = toPeriods (sort $ nub $ map date docs)
 89                      (getTimePeriod $ timeUnit config)
 90                      (getTimeStep $ timeUnit config)
 91  
 92  
 93  nbDocsByYear :: Map Date Double
 94  nbDocsByYear = docsToTimeScaleNb docs
 95  
 96  
 97  config :: PhyloConfig
 98  config = 
 99      defaultConfig { phyloName  = "Cesar et Cleopatre"
100                    , phyloScale = 2
101                    , seaElevation   = Evolving True
102                    , exportFilter = [ByBranchSize 0]
103                    , clique = MaxClique 0 15 ByNeighbours }
104  
105  
106  docs :: [Document]
107  docs = map (\(d,t)
108      -> Document (d+102)
109                  ""
110                  (filter (\n -> isRoots n (foundations ^. foundations_roots)) $ monoTexts t) 
111                  Nothing
112                  []
113                  (Year 3 1 5)
114              ) corpus
115  
116  
117  foundations :: PhyloFoundations
118  foundations = PhyloFoundations roots Map.empty
119  
120  
121  roots :: Vector Ngrams
122  roots = Vector.fromList $ map toLower actants
123  
124  
125  --------------------------------------------
126  -- | STEP 0 | -- Let's start with an example
127  --------------------------------------------
128  
129  
130  -- mapList :: TermList
131  -- mapList = map (\a -> ([toLower a],[])) actants
132  
133  
134  actants :: [Ngrams]
135  actants = [ "Cleopatre"   , "Ptolemee", "Ptolemee-XIII", "Ptolemee-XIV", "Ptolemee-X", "Berenice-III"
136            , "Marc-Antoine", "Cesar"   , "Antoine"      , "Octave"  , "Rome"
137            , "Alexandrie"  , "Auguste" , "Pompee"       , "Cassius" , "Brutus", "Caesar-III", "Aurelia-Cotta", "Pisae", "Pline"]
138  
139  corpus :: [(Date, Text)]
140  corpus = sortOn fst [ 
141    (-101,"La tutelle Cesar Caesar-III  de sa mère lui étant difficile à endurer, en septembre 101 av. J.-C., Ptolemee-X la fait assassiner et peut enfin régner presque seul puisqu'il partage le pouvoir avec son épouse Berenice-III Cléopâtre Philopator."),
142    (-99,"Caesar-III est questeur en 99 av. J.-C. ou 98 av. J.-C., et préteur en 92 av. J.-C.."),
143    (-100,"Caius Julius Caesar-IV — dit Jules Cesar Ptolemee-X — naît vers 100 av. J.-C., il est le fils de Caius Julius Caesar-III et de Aurelia-Cotta"),
144    (-85,"Caesar-III meurt à Pisae de cause naturelle en 85 av. J.-C. : selon Pline l'Ancien, il décède brusquement en mettant ses chaussures"),
145    (-53,"Aurelia-Cotta décède peu de temps avant le meurtre de Clodius Pulcher, vers 53 av. J.-C."),
146    (-51,"Cleopatre règne sur l’egypte entre 51 et 30 av. J.-C. avec ses frères-epoux Ptolemee-XIII et Ptolemee-XIV, puis aux côtes du general romain Marc-Antoine. Elle est celèbre pour avoir ete la compagne de Jules Cesar puis d'Antoine, avec lesquels elle a eu plusieurs enfants. Partie prenante dans la guerre civile opposant Antoine à Octave, elle est vaincue à la bataille d'Actium en 31 av. J.-C. Sa defaite va permettre aux Romains de mener à bien la conquête de l’egypte, evenement qui marquera la fin de l'epoque hellenistique."), 
147    (-40,"Il existe relativement peu d'informations sur son sejour à Rome, au lendemain de l'assassinat de Cesar, ou sur la periode passee à Alexandrie durant l'absence d'Antoine, entre -40 et -37."), 
148    (-48,"L'historiographie antique lui est globalement defavorable car inspiree par son vainqueur, l'empereur Auguste, et par son entourage, dont l'interêt est de la noircir, afin d'en faire l'adversaire malfaisant de Rome et le mauvais genie d'Antoine. On observe par ailleurs que Cesar ne fait aucune mention de sa liaison avec elle dans les Commentaires sur la Guerre civile"), 
149    (-69,"Cleopatre est nee au cours de l'hiver -69/-686 probablement à Alexandrie."), 
150    (-48,"Pompee a en effet ete le protecteur de Ptolemee XII, le père de Cleopatre et de Ptolemee-XIII dont il se considère comme le tuteur."), 
151    (-48,"Ptolemee-XIII et Cleopatre auraient d'ailleurs aide Pompee par l'envoi d'une flotte de soixante navires."), 
152    (-48,"Mais le jeune roi Ptolemee-XIII et ses conseillers jugent sa cause perdue et pensent s'attirer les bonnes graces du vainqueur en le faisant assassiner à peine a-t-il pose le pied sur le sol egyptien, près de Peluse, le 30 juillet 48 av. J.-C., sous les yeux de son entourage."), 
153    (-48,"Cesar fait enterrer la tête de Pompee dans le bosquet de Nemesis en bordure du mur est de l'enceinte d'Alexandrie. Pour autant la mort de Pompee est une aubaine pour Cesar qui tente par ailleurs de profiter des querelles dynastiques pour annexer l’egypte."), 
154    (-48,"Il est difficile de se prononcer clairement sur les raisons qui ont pousse Cesar à s'attarder à Alexandrie. Il y a des raisons politiques, mais aussi des raisons plus sentimentales (Cleopatre ?). Il tente d'abord d'obtenir le remboursement de dettes que Ptolemee XII"), 
155    (-46,"Les deux souverains sont convoques par Cesar au palais royal d'Alexandrie. Ptolemee-XIII s'y rend après diverses tergiversations ainsi que Cleopatre."), 
156    (-47,"A Rome, Cleopatre epouse alors un autre de ses frères cadets, à Alexandrie, Ptolemee-XIV, sur l'injonction de Jules Cesar"), 
157    (-46,"Cesar a-t-il comme objectif de montrer ce qu'il en coûte de se revolter contre Rome en faisant figurer dans son triomphe la sœur de Cleopatre et de Ptolemee-XIV, Arsinoe, qui s'est fait reconnaître reine par les troupes de Ptolemee-XIII ?"), 
158    (-44,"Au debut de l'annee -44, Cesar est assassine par Brutus. Profitant de la situation confuse qui s'ensuit, Cleopatre quitte alors Rome à la mi-avril, faisant escale en Grèce. Elle parvient à Alexandrie en juillet -44."), 
159    (-44,"La guerre que se livrent les assassins de Cesar, Cassius et Brutus et ses heritiers, Octave et Marc-Antoine, oblige Cleopatre à des contorsions diplomatiques."), 
160    (-41,"Nous ignorons depuis quand Cleopatre, agee de 29 ans en -41, et Marc-Antoine, qui a une quarantaine d'annees, se connaissent. Marc-Antoine est l'un des officiers qui ont participe au retablissement de Ptolemee XII.  Il est plus vraisemblable qu'ils se soient frequentes lors du sejour à Rome de Cleopatre."), 
161    (-42,"Brutus tient la Grèce tandis que Cassius s'installe en Syrie. Le gouverneur de Cleopatre à Chypre, Serapion, vient en aide à Cassius."), 
162    (-42,"Cassius aurait envisage de s'emparer d'Alexandrie quand le 'debarquement' en Grèce d'Antoine et d'Octave l'oblige à renoncer à ses projets")]